计划免疫的原则之一是安全第一。百白破疫苗与其他疫苗一样，在儿童发热或患有急性传染病以及恢复期，患有心、肝、肾等重要脏器疾病，有过敏史者均不能接种百白破疫苗。如果在接种第一或第二针百白破疫苗后，因疫苗反应出现高热甚至惊厥者，也不能再继续接种。除了以上一般禁忌症外，如果儿童有神经系统疾病，如有癫痫、抽风病史，或神经系统发育不正常以及神经系统损伤均应视为百白破疫苗的禁忌症。由于百白破疫苗接种后发生发热反应的概率偏高，所以儿童如果有呼吸道感染症状，如咽部发红、咳嗽、流鼻涕、流眼泪、眼结膜充血等卡他症状，也建议暂缓接种。